為迎戰年底九合一地方選舉，在野的國民黨與民眾黨規劃提出多項公投提案，並擬與選舉合併舉行。其中，國民黨主推「鞭刑（打詐）」、「反廢死」及「重啟核電」，民眾黨則聚焦「移轉投票（不在籍投票）」與「交通罰鍰全數用於改善道路交通安全環境及補貼大眾運輸」，合計約5項議題。不過，無論藍綠白各方，乃至兩個在野黨內部，對於提案內容與時程都出現不同聲音。
提案內容與時程
依《公民投票法》規定，公投案須先經立法院院會處理、於投票日前一定期間公告。6月26日，立法院院會中，藍營的反廢死公投與白營的交通罰鍰公投兩案逕付二讀，未來將由兩黨團分別召集協商。其中反廢死公投的提案主文為「您是否同意『各級法院合議庭法官判處死刑不應侷限於一致決』之政策？」
關於核電議題，國民黨立委羅廷瑋表示，核三重啟程序已在進行中，黨團仍需就「以核養綠」或核一、核二、核四的具體方向進一步討論後再對外說明。
藍白之間的協調與分歧
藍白雖同為在野陣營，但對彼此主打的議題各有保留。民眾黨對國民黨力推的鞭刑公投有疑慮，黨團立委洪毓祥認為，不應僅以情緒性的重刑回應民怨，把刑法推向「羞辱化、肉刑化」仍須審慎思考；而國民黨則對民眾黨主張的「移轉投票（不在籍投票）」持保留態度，黨團書記長林沛祥稱會與友黨溝通協調，黨內並有意見認為推動台澎金馬不在籍投票未必增加選票，且可能改變離島選民結構。
國民黨立委羅廷瑋則說明，白營並非反對反廢死、鞭刑，而是希望先進行司法改革後再處理這兩項議題。
國民黨內部曾有反覆
鞭刑公投在國民黨內部一度出現變化。6月26日上午，黨中央一度喊卡，稱鞭刑涉及刑事政策與價值討論，尚待凝聚社會共識；主推的立委洪孟楷則回應，民意希望「亂世用重典」，對黨中央說法表示難以理解。黨主席鄭麗文當日受訪表示，不希望重現2018年公投綁大選的亂象，盼在野黨集中於一、兩個重大公投案。不過當晚黨團發布新聞稿指出，經與鄭麗文交換意見後達成共識，死刑、鞭刑打詐及重啟核能等3項公投都會推動。
支持方的理由
支持者多強調民意與政策需求。台中市長盧秀燕表態支持鞭刑入法公投，認為部分窮凶惡極的犯罪型態人神共憤，加重其刑可達嚇阻作用、彰顯司法正義。國民黨文傳會主委陳以信則說，公投與地方選舉結合的目的之一在於民主深化，讓選民關心全國性議題；尤其在AI、半導體與基礎建設帶動用電需求下，核能已成各縣市共同面對的課題。
不過，雲林縣長張麗善也提醒，公投結果代表全民意志，中央應慎重考慮並落實執行，否則公投將失去意義。
反對與質疑的聲音
執政的民進黨則持批評立場。民進黨團幹事長莊瑞雄表示，藍白一次拋出多項公投還想綁年底選舉，與其說是解決問題，不如說是製造話題、綁架選舉。他指出，反廢死、鞭刑涉及憲法、人權與司法制度；重啟核電也不能跳過核安、核廢料與地方共識；民進黨團將在立法院逐案檢視每項公投是否符合憲法與法治。
民進黨立委吳思瑤則質疑相關提案的適法性，認為許多議題可透過監督與修法解決，要求中選會嚴格把關；民眾黨主席黃國昌反批民進黨，過去高舉公投民主，如今卻把公投視為洪水猛獸。
值得注意的是，連在野陣營內部也有不同評估。部分國民黨人士認為，全國性公投題目對帶動地方選舉投票率效果有限，且就算通過，執政黨未必照做，恐讓選民產生「投了也沒用」的無力感。民眾黨前主席柯文哲也指出，在司法社會信任度偏低的情況下推動鞭刑、死刑公投有其盲點，主張應先改善司法信任度。
中選會態度
中選會主委游盈隆對於藍白倡議的多項公投案，以「一個恰恰好、兩個有點多、三個受不了」表達看法，並呼籲各方「不要有太多政黨之間的敵意」。
整體而言，這5項公投提案後續能否順利成案、是否如期與年底選舉合併舉行，以及各黨如何整合內部與彼此立場，仍有待觀察。
